El jardín botánico universitario cuenta actualmente con diez secciones de plantas, divididas tomando en cuenta criterios geográficos, ecológicos, taxonómicos y de usos.

Secciones del Jardín Botánico

• Arboretum
• Zona norte
• Zona centro templada
• Zona centro semiárida
• Zona sur
• Plantas de importancia económica
• Humedal de temporal
• Palmetum
• Vegetación riparia
• Quercetum